Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms