Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms