Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms