Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms