Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms