Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SH3BP4Q9P0V3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SH3BP4Q9P0V3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SH3BP4Q9P0V3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SH3BP4Q9P0V3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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SH3BP4Q9P0V3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SH3BP4Q9P0V3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SH3BP4Q9P0V3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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