Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT84Q9NSB2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms