Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms