Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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