Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZYG11BQ9C0D3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms