Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms