Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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