Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms