Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms