Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms