Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms