Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PITX2Q99697 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PITX2Q99697 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PITX2Q99697 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PITX2Q99697 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PITX2Q99697 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PITX2Q99697 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX2Q99697 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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