Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF4Q99607 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms