Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms