Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
JSRP1Q96MG2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
JSRP1Q96MG2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JSRP1Q96MG2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms