Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms