Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms