Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms