Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms