Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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UBE2E3Q969T4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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UBE2E3Q969T4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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UBE2E3Q969T4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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UBE2E3Q969T4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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UBE2E3Q969T4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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