Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms