Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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USP13Q92995 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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