Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM41Q8WV44 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms