Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms