Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LNX2Q8N448 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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