Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CLIP4Q8N3C7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CLIP4Q8N3C7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CLIP4Q8N3C7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CLIP4Q8N3C7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CLIP4Q8N3C7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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