Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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