Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms