Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q6P435 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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