Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms