Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP350Q5VT06 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms