Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms