Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms