Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms