Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms