Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms