Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMG9

TMEM52B, Transmembrane protein 52B, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM52BQ4KMG9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms