Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms