Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms