Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF827Q17R98 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms