Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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