Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms