Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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