Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXT1Q16394 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms