Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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